造成孵化率低的原因一般是由于孵化過(guò)程中溫度、濕度沒(méi)有控制好，受精蛋受病菌感染，或者是畸形胚胎造成的。具體有以下幾種情況：
1．蛋內有血環(huán)，胚胎在1～4天死亡，種蛋存放時(shí)間過(guò)長(cháng)，或貯存的溫度、濕度不當；運輸過(guò)程中過(guò)度震蕩碰撞；入孵初期溫度過(guò)高；種蛋消毒過(guò)甚；種雞營(yíng)養缺乏或失調；母源性或蛋殼帶來(lái)病原微生物感染胚胎等。
2．胚胎多在孵化后2周死亡，孵化的溫度過(guò)高或過(guò)低；通風(fēng)不良，二氧化碳濃度高；種雞飼料中的蛋白質(zhì)、維生素、礦物質(zhì)缺乏。
3．啄單孔無(wú)力將孔口擴大，臨近啄殼時(shí)溫度突然猛增。濕度太低，通風(fēng)換氣不良，種雞飼料中維生素A 、維生素B1、維生素B2、維生素B12缺乏時(shí)，這種現象最多見(jiàn)。
4．氣室大，胚胎死于殼內，孵化溫度過(guò)高，濕度過(guò)低，種蛋營(yíng)養不良。
5．胚胎多在孵化第2周死亡，種蛋存放溫度較高；孵化溫度過(guò)高或過(guò)低，通風(fēng)不良；種雞營(yíng)養不良或失調，維生素缺乏；母源性或蛋殼帶來(lái)病源性微生物感染胚胎；翻蛋次數過(guò)少或角度太小。
6.氣室小，胚胎死于殼內，通氣不良，有害氣體過(guò)多，濕度過(guò)大。
7．氣室正常，胚胎死于殼內，種雞營(yíng)養缺乏或失調。特別是維生素缺乏容易出現這種情況。甚；種雞遺傳性孵化率低。
8．入孵第1～6天死胚增多，孵化溫度過(guò)高或過(guò)低；通風(fēng)不良；種蛋存放時(shí)間過(guò)長(cháng)，種蛋蒸熏消毒過(guò)。